Положение об установке «ФИТОБИОГЕН»

Уникальная научная установка «Научный центр биотехнологии, геномики и депонирования растений» (УНУ «ФИТОБИОГЕН»), создана на базе Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Ордена Трудового Красного Знамени Никитский ботанический cад – Национальный научный центр РАН» в 2019 г. Руководителем УНУ является кандидат биологических наук Хватков Павел Алексеевич (+7(918)407-68-31, khvatkov1987@gmail.com). Фактическое место расположения Установки — 298648, Россия, Республика Крым, г. Ялта, пгт Никита, Никитский спуск 52, Никитский ботанический сад.

Уникальность данной установки обусловлена наличием широкого спектра оборудования (в том числе изготовленного специально под нужды УНУ), функционирующего в виде единого комплекса, позволяющего решать широкий спектр задач. Более подробная информация об оборудовании УНУ представлена в Перечне оборудования УНУ ФИТОБИОГЕН. Коллектив сотрудников, обеспечивающий функционирование УНУ, сформирован на базе научного подразделения ФГБУН НБС-ННЦ РАН – отдел геномных и постгеномных технологий в ратениеводстве. На базе УНУ возможно проведение биотехнологических и геномных исследований видов, сортов и форм растений, а также депонирование ценных растительных образцов для решения задач интродукции, селекции, размножения и сохранения биоразнообразия растений.

Основной задачей УНУ является проведение научных изысканий для поиска путей регенерации и клонального микроразмножения сельскохозяйственных растений. УНУ «ФИТОБИОГЕН» обладает потенциалом производства 1,5-2,0 млн. саженцев в год. В 2020 году в тестовом режиме впервые в России была произведена партия оздоровленного материала (тестировка осуществлялась методом от-ПЦР) подвоя винограда Кобер 5ББ (50 тыс. шт.), в том числе и для обновления коллекционных насаждений ВНИИ ВиВ «Магарач». В 2023 году проведено тиражирование методом клонального микроразмножения 10 тыс. шт. подвоя розы для потребностей ФГБУН «НБС-ННЦ». Ведутся работы по оздоровлению подвоя семечковых культур КА-104. На базе УНУ осуществляется поддержание 37 генотипов винограда, 5 подвоев семечковых и 3 подвоев косточковых культур для закладки будущих маточников у индустриальных партнёров. Более подробная информация о доступе к оборудованию УНУ осуществляется в соответствии с Положением о УНУ и его Регламентом.

Научными направлениями УНУ являются:

–  изучение биологии культивируемых клеток, органов и тканей, особенностей выделения протопластов, их применения в биотехнологии и геномик;

– исследование основных путей реализации морфогенеза іn vitro и факторов абиотической и биотической природы, регулирующих процессы регенерации культурных и дикорастущих растений;

– разработка методов соматического эмбриогенеза и органогенеза основных садовых культур и эндемичных видов растений;

– анатомо-морфологические и физиологические исследования культивируемых in vitro эксплантов;

– разработка систем регенерации растений в условиях in vitro с целью восстановления численности редких и исчезающих видов растений дикорастущей флоры и получения новых БАВ, ускорения интродукционного процесса путём размножения в условиях in vitro новых видов, сортов, представленных в единичных экземплярах и трудноразмножаемых традиционными методами;

– разработка новых высокоэффективных технологий оздоровления и применение современных методов диагностики вирусных фитопатогенов;

– селекция in vitro (разработка реципиентных систем растений in vitro для различных последующих манипуляций, создание новых селекционных форм устойчивых к факторам биотической и абиотической природы, получение генетического разнообразия с использованием биотехнологических методов эмбриокультуры, гаплоидии, индуцированного мутагенеза, биоинженерии, редактирования генома);

– исследования геномной идентификации растений, включающие в себя выделение ДНК И РНК, создание генетического банка растений, проведение ПЦР, ОТ-ПЦР, электрофореза в агарозном геле, капиллярного электрофореза, полногеномного секвенирования, транскриптомного анализа и создания библиотек генов;

– создание медленно растущих коллекций in vitro ценных видов сортов и форм растений;

– разработка методов депонирования, включая сохранение при низких положительных температурах и криоконсервацию, акклиматизации пробирочных растений;

– выращивание экспериментальных растений в условиях заданного микроклимата, с оценкой их адаптационных свойств;

– выращивание растений-индикаторов и трансгенных растений.

Деятельность УНУ осуществляется с помощью применения стандартных методик биоинженерии растений и уникальных методик, разработанных непосредственно в ФГБУН НБС-ННЦ РАН:

– моделирование контролируемых условий, необходимых для длительного хранения растительного материала декоративных, ароматических и плодовых культур в генобанке in vitro;

– методология биотехнологических исследований цветочно-декоративных культур;

– основы создания генобанка in vitro видов, сортов и форм декоративных, ароматических и плодовых культур.

Типовыми услугами, оказываемыми УНУ, являются:

– проведение геномных исследований растений (ПЦР, ОТ-ПЦР, капиллярный электрофорез, иммуноблот, гибридизация по Саузерну, полногеномное секвенирование, создание библиотек генов и др.);

– акклиматизация ex vitro и in vivo растений в условиях современной теплицы «Фитотрон» с регулируемыми климатическими параметрами;

– проведение экспериментов на растениях по устойчивости к абиотическому стрессу, фенотипические наблюдения и др. в условиях лабораторных модулей и закрытого грунта с регулируемыми климатическими параметрами;

– диагностика фитопатогенов вирусной природы с помощью ИФА и ПЦР;

– закладка на депонирование in vitro особо ценных растительных объектов и сохранение в генобанке in vitro введённых в культуру эксплантов сортов и форм плодовых, эфиромасличных, декоративных культур и видов дикорастущих растений;

– оздоровление посадочного материала в условиях in vitro;

– подбор условий для регенерации трудноразмножаемых и ценных сортов культурных растений, дикорастущих видов флоры РФ и других регионов мира.

Форма заявки на выполнение работ и оказание услуг для проведения научных исследований, а также осуществления экспериментальных разработок оформляется согласно Регламенту доступа заинтересованных пользователей к УНУ «Научный центр биотехнологии, геномики и депонирования растений» («ФИТОБИОГЕН»). Также возможна подача заявки на услуги УНУ посредствам интерактивной формы, расположенной по адресу https://ckp-rf.ru/catalog/usu/669802/.  Расчёт стоимости услуг (типовых и не типовых) УНУ осуществляется бухгалтерией ФГБУН НБС-ННЦ РАН по согласованию с руководителем УНУ «ФИТОБИОГЕН» и предоставляется для согласования заказчику в виде калькуляции стоимости услуги из расчёта на каждую единицу биологического образца/растения. В виду существенных биологических различий исследуемых культур, план работы УНУ и сроки выполнения заявок на услуги УНУ формируются на основе поступающих заявок и составляются руководителем УНУ (Хватков Павел Алексеевич, +7(918)407-68-31, khvatkov1987@gmail.com) и согласовываются с заказчиком индивидуально. Более подробная информация о порядке выполнения заказанных работ и обязательствах сторон представлена в Проекте договора на выполнение работ и оказания услуг для проведения научных исследований, а также осуществления экспериментальных разработок.

Проект договора на выполнение работ и оказания услуг для проведения научных исследований, а также осуществления экспериментальных разработок

Проект договора на выполнение работ и оказания услуг для проведения научных исследований

Перечень оборудования УНУ ФИТОБИОГЕН

Перечень оборудования УНУ ФИТОБИОГЕН

Положение об уникальной научной установке «Научный центр биотехнологии, геномики и депонирования растений» («ФИТОБИОГЕН»)

Регламент доступа заинтересованных пользователей к УНУ «Научный центр биотехнологии, геномики и депонирования растений» («ФИТОБИОГЕН»)

Положение

об уникальной научной установке «Научный центр биотехнологии, геномики и депонирования растений» («ФИТОБИОГЕН»)

1. Уникальная научная установка «Научный центр биотехнологии, геномики и депонирования растений» («ФИТОБИОГЕН»), именуемая в дальнейшем УНУ, создана на базе Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Ордена Трудового Красного Знамени Никитский ботанический cад – Национальный научный центр РАН» в 2019 г.
2. Место нахождения и почтовый адрес: ФГБУН «Ордена Трудового Красного Знамени Никитский ботанический cад – Национальный научный центр РАН», Россия, Республика Крым, 298648, пгт. Никита, г. Ялта, спуск Никитский, 52.
3. УНУ действует в соответствии с законодательством Российской Федерации, решениями федеральных органов исполнительной власти, Уставом и нормативно-правовыми актами базовой организации – ФГБУН «НБС-ННЦ», а также настоящим положением. УНУ подчиняется непосредственно научному руководителю УНУ.
4. УНУ предназначена для проведения биотехнологических, геномных исследований и депонирования растительных объектов.
5. Целями УНУ являются:

5.1. обеспечение на современном уровне проведения исследований, а также оказание заинтересованным пользователям услуг (измерений, исследований и испытаний) на имеющемся научном оборудовании;

5.2. осуществление равномерной загрузки научного оборудования УНУ;

5.3. обеспечение единства и достоверности проводимых фундаментальных работ в процессе научных исследований на оборудовании УНУ;

5.4. реализация мероприятий развития УНУ.

6. Основными задачами УНУ являются:

6.1. выполнение исследований на научном оборудовании УНУ силами исследовательского персонала УНУ в интересах подразделений работающих в области биотехнологии, геномики и депонирования растений базовой организации и других пользователей, работающих по научным тематикам, согласующимся с базовыми принципами стерильных лабораторных модулей, в том числе осуществление диссертационных исследований;

6.2. сотрудничество с высшими учебными заведениями по вопросам проведения научных исследований и подготовки научных кадров высшей квалификации (студентов-магистров, аспирантов и докторантов) на базе научного оборудования УНУ;

6.3. осуществление мероприятий по совершенствованию обеспечения эффективного функционирования научного оборудования и других объектов УНУ, по развитию материально-технической базы и развитию кадрового потенциала;

6.4. выполнение комплекса постоянных научно-исследовательских работ в рамках, госзаданий, грантов различных научных фондов, государственных целевых программ, направленных на поддержание современного уровня УНУ, усовершенствование базы проводимых исследований.

7. Научные направления деятельности УНУ:

7.1. изучение биологии культивируемых клеток, органов и тканей, особенностей выделения протопластов, их применения в биотехнологии и геномике, исследование основных путей реализации морфогенеза in vitro и факторов абиотической и биотической природы, регулирующих процессы регенерации культурных и дикорастущих растений;

7.2. разработка методов соматического эмбриогенеза и органогенеза основных садовых культур и эндемичных видов растений, анатомо-морфологические и физиологические исследования культивируемых in vitro эксплантов;

7.3. разработка систем регенерации растений в условиях in vitro с целью восстановления численности редких и исчезающих видов растений дикорастущей флоры и получения новых БАВ;

7.4. ускорение интродукционного процесса путем размножения в условиях in vitro новых видов, сортов, представленных в единичных экземплярах и трудноразмножаемых традиционными методами;

7.5. разработка новых высокоэффективных технологий оздоровления и применение современных методов диагностики вирусных фитопатогенов;

7.6. селекция in vitro: разработка реципиентных систем растений in vitro для различных последующих манипуляций, создание новых селекционных форм устойчивых к факторам биотической и абиотической природы, получение генетического разнообразия с использованием биотехнологических методов (эмбриокультуры, гаплоидии, индуцированного мутагенеза, биоинженерии, редактирования генома);

7.7. геномные исследования растений, включающие в себя выделение ДНК и РНК, создания генетического банка растений, проведение ПЦР, ОТ-ПЦР, ПЦР в реальном времени, электрофореза в агарозе, капиллярного электрофореза, полногеномного секвенирования, транскриптомного анализа и создания библиотек генов;

7.8. создание медленно растущих коллекций in vitro ценных видов сортов и форм растений, разработка методов депонирования, включая сохранение при низких положительных температурах и криоконсервацию;

7.9. акклиматизация пробирочных растений, выращивание экспериментальных растений в условиях заданного микроклимата, с оценкой их адаптационных свойств. Выращивание растений-индикаторов и трансгенных растений.

7.10 Приоритетные направления развития науки, технологий, техники Российской Федерации, к которым могут относиться результаты научной деятельности на УНУ:

— Науки о жизни;

— Рациональное природопользование.

7.11 Критические технологии Российской Федерации, к которым относятся результаты научных исследований, полученных с использованием УНУ: — Клеточные технологии; — Геномные, протеомные и постгеномные технологии; — Нано-, био-, информационные, когнитивные технологии; — Технологии биоинженерии.

8. Организация и структура УНУ.

Коллектив сотрудников, обеспечивающий функционирование УНУ, сформирован на базе научных подразделений ФГБУН «Ордена Трудового Красного Знамени Никитский ботанический cад – Национальный научный центр РАН»: лаборатории биотехнологии и вирусологии растений, лаборатории геномики растений и биоинформатики, лаборатории биоинженерии растений.

9. Оборудование УНУ.

Состав научного оборудования УНУ формируется научным руководителем УНУ.

10. Финансирование деятельности УНУ.

Финансирование деятельности УНУ осуществляется ФГБУН «Ордена Трудового Красного Знамени Никитский ботанический cад – Национальный научный центр РАН», в том числе в рамках выполнения государственных контрактов, субсидий и грантов государственных и негосударственных научных фондов, средств субсидий федерального бюджета на выполнение целевых программ и иных источников, предусматривающих работы с использованием УНУ.

11. Организация деятельности УНУ.

11.1 Руководство деятельностью УНУ осуществляется научным руководителем УНУ, назначаемым приказом директора ФГБУН «НБС-ННЦ РАН» по согласованию с руководством структурного подразделения, осуществляющего эксплуатационную поддержку УНУ.

11.2 Порядок обеспечения проведения научных исследований и оказания услуг на базе УНУ определяет руководитель УНУ.

11.3 Услуги пользования научным оборудованием могут предоставляться как на возмездной, так и безвозмездной основе. Проведение научных исследований с помощью оборудования УНУ и оказание услуг на возмездной осуществляется на основе договора между организацией-заказчиком и ФГБУН «НБС-ННЦ РАН».